ব্লাস্ট

ব্লাস্ট (ইখঅঝঞ) হলো একটি ‘বেসিক লোকাল অ্যালাইনমেন্ট সার্চ টুল’, একটি অ্যালগরিদম যা প্রাথমিক জৈবিক অণুক্রমের তুলনা করতে ব্যবহৃত হয়; যেমন ডিএনএ বা আরএনএ অণুক্রমের নিউক্লিওটাইড বা প্রোটিনের অ্যামিনো-অ্যাসিড। একটি ব্লাস্ট অনুসন্ধান একজন বিজ্ঞানীকে প্রোটিন বা নিউক্লিওটাইড ক্রমের সাথে অণুক্রমের তথ্যভান্ডারের তুলনা করতে এবং উদ্দিষ্ট অণুক্রমের অনুরূপ database sequences সনাক্ত করতে সাহায্য করে।

ব্লাস্ট হলো এক প্রকার প্রোগ্রামের সমষ্টি। এর মধ্যে রয়েছে: (১) নিউক্লিওটাইড-নিউক্লিওটাইড ব্লাস্ট (ব্লাস্ট এন): সবচেয়ে অনুরূপ ক্রমগুলো খুঁজে পেতে অভীষ্ট ডিএনএ অণুক্রম ডিএনএ তথ্যভান্ডারে জমা দেওয়া হয়; (২) প্রোটিন-প্রোটিন ব্লাস্ট (ব্লাস্ট পি): ব্লাস্ট এন-এর মতো, প্রোটিন তথ্যভান্ডার থেকে সবচেয়ে অনুরূপ প্রোটিন ক্রমগুলো সনাক্ত করতে প্রোটিন অণুক্রম তথ্যভান্ডারে জমা দেওয়া হয়; (৩) অবস্থান-নির্দিষ্ট পুনরাবৃত্তিমূলক ব্লাস্ট (পিএসআই-ব্লাস্ট) (ব্লাস্ট পিজিপি): এই প্রোগ্রামটি প্রোটিনের দূরবর্তী আত্মীয়দের খুঁজে বের করার জন্য প্রয়োগ করা হয়; (৪) নিউক্লিওটাইড ৬-ফ্রেম অনুবাদ প্রোটিন (ব্লাস্ট এক্স): এই প্রোগ্রামটি প্রোটিন সিকোয়েন্স তথ্যভান্ডারের সাথে অধ্যয়নকৃত নিউক্লিওটাইড অণুক্রমের (উভয় স্ট্র্যান্ড) ছয়-ফ্রেমের ধারণাগত সংশ্লেষণ-পণ্যকে তুলনা করে (৫) নিউক্লিওটাইড ৬-ফ্রেম অনুবাদ-নিউক্লিওটাইড ৬-ফ্রেম সংশ্লেষণ (টি ব্লাস্ট এক্স): এই প্রোগ্রামটি নিউক্লিওটাইড ক্রমগুলোর মধ্যে দূরবর্তী সংযোগসমূহ খুঁজে বের করার জন্য প্রয়োগ করা হয় (৬) প্রোটিন-নিউক্লিওটাইড ৬-ফ্রেম সংশ্লেষণ (টি ব্লাস্ট এন): এই প্রোগ্রামের সকল ছয়-নিউক্লিওটাইড অণুক্রমের তথ্যভান্ডারের রিডিং ফ্রেমের সাথে বাঞ্ছিত প্রোটিনের তুলনা করা হয়। (৭) বড় query sequences এর জন্য (মেগা ব্লাস্ট): এই প্রোগ্রামটি অধিকসংখ্যক ইনপুট সিকোয়েন্সের তুলনা কম সময়ে করতে সক্ষম যা বব্লাস্টের পুনরাবৃত্তির চেয়ে সহজ ও সময় সাশ্রয়ী। [আনোয়ার হোসেন]